關於女性肥胖與婦科疾病最有密切關聯的就是多囊性卵巢症候群。 常見症狀包括無月經或月經不規則、不易懷孕、易流產、多毛症、肥胖、痤瘡、落髮、脂漏性皮膚炎、黑色棘皮病、卵巢呈現多發性的囊狀腫大。大部份的患者未必俱備以上的全部症狀。
多囊性卵巢症的病人在做超音波檢查時發現兩邊卵巢長出許多小囊,這些小囊大小約2~8mm,小囊數目每邊卵巢約10個以上,這種卵巢我們稱為多囊性卵巢。隨著時間愈久,這些小囊會只分布在卵巢周圍的外側,類似珍珠項鍊的形狀;而且會分泌雄性荷爾蒙進入血液中,使女性患者引起一些症狀,如:月經不規則(月經稀發或無月經症)、肥胖、多毛、長青春痘、禿頭等症狀。這些症狀有輕有重,或具有多囊性卵巢者不一定有症狀出現,有症狀發生時才稱為多囊性卵巢症。
具有「多囊性卵巢」者佔生育婦女的20%,但有「多囊性卵巢症」者只佔生育婦女的6%。目前有些人是以「雄性素過多與慢性不排卵症候群」來說明這個症候群的含意,認為與其由卵巢之解剖上的變異來探討其病因與表現,不如著重於這種症候群所代表的賀爾蒙系統的異常。